该剧讲述了明代传奇人物张居正（唐国强 饰）的一生。出身微寒的张居正从乡试秀才、举人、进士，官至内阁大学士，一步步成为治国良相。他协助幼年登基的小皇帝，整饬吏治，刷新颓风，日夜操劳，为即将倾废的明朝基业呕心呖血数载。张居正为国奔忙，连老父亲去世都没顾上回家奔丧，而他自己也于万历十年六月二十日耗尽了最后一丝心血，他死后，神宗帝为之辍朝。由于生前在改革朝制中得罪了一些意见相左的幕僚，加之用人上有些失误，他死后有人开始对当朝展开了诋毁和攻击。而神宗也在张居正生前忌惮他功高盖主，威胁到自己的皇权，于是下令查抄张居正全家......

晚清，中国内忧外患。在曾国藩等人的筹办下，江南机器制造总局应运而生。邝福海受捻军的派遣前来阻挠，与梦想自建坚船利炮的徐华容结成生死之交。徐华容传播西方科学，推行洋务运动，阻止李鸿章用造船经费购买外国军舰，呕心沥血赶造兵舰，但最终功亏一篑。“甲午战争”惨败后，洋务运动破产，江南制造局成众矢之的。徐华容奔走呼号，惨淡经营，迎来辛亥革命。邝继业从日本回国后，在中共党人李印夏帮助下，发动工人运动，抗拒军阀掠夺，结束摩根称霸江南的时代。日本发动侵华战争，江南造船厂被长崎造船所吞噬。第三代江南共产党人孙翔龙、杨胜国和工程师汪同宾与日寇斗智斗勇，为新四军偷运军需物资，输送军工人才。解放伊始，江南造船厂为装备新中国第一支海军部队，成功实施一江山岛登陆作战立下了赫赫战功。