因为母亲的事业，艾达不得不搬到另一个城镇，成为温特斯坦学校的“新女孩”。 她在新的班级里日子不好过交不到朋友的的艾达不得已只能呆在羞涩内向的本尼旁边。 一天，艾达的老师把孩子们介绍给莫蒂默·莫里森——一个周游世界寻找“神奇动物”的人。 每一种动物都注定要成为孩子的灵魂伙伴。 在所有人中，转校生艾达和本尼是班上最先拥有魔法伙伴的人! 从现在起，本尼身边就有一只古老而聪明的海龟，而艾达有一只狡猾的狐狸。 当物品在学校里不断消失，学校出现了超级小偷。孩子们和神奇的小动物为了帮助朋友洗刷嫌疑，解开超级小偷之谜。

影片改编自Nicholas Hogg2015年的小说《东京无名氏》（Tokyo Nobody）。　　美国社会心理学家本-门罗（Ben Monroe）在调查柏林当地一个与令人不安的事件有关的邪教组织，他沉浸在自己的工作中时，他叛逆的女儿马兹（Mazzy）却被一个神秘的当地男孩接触，这个男孩将她带入了这座城市的地下世界。当他们的两个世界走向危险的交汇点时，本需要争分夺秒地拯救女儿……