《五星红旗迎风飘扬2》承接“两弹一星”的故事，从1970年4月我国第一颗人造卫星上天写起，着力塑造毛泽东、周恩来、邓小平等老一辈革命家运筹帷幄，在复杂多变和严峻的国际环境中，审时度势，从容应对，始终立于主动地位。为了维护祖国的主权、领土完整和民族尊严，他们进行的坚定而有理有力的斗争，在严重困难面前，他们带领全国人民，迎难而上，以不屈的姿态和昂扬的精神面貌去战胜和克服困难，终于走出了一条中国特色的社会主义道路。

20世纪20年代，数千年的封建王朝土崩瓦解，然而在历史黎明的曙光到来之前，古老的中华民族却进入了最为黑暗的军阀割据和混战兼并的时代。西安侦缉队队长马腾云与黑道公子曲大通沆瀣一气，为了钱财不惜杀害相好的女子小翠。侦缉队副队长何远新受命调查此案，在和武生傅天豪相谈过程中，逐渐将目标锁定在曲大通的身上。调查脉络逐渐清晰，而就在关键时刻马腾云借故将何支走，随后设下毒辣圈套陷害傅天豪。　　得知消息的何远新大为震惊，他赶回西安后不顾万难追查一连串案件的真相，纵使头破血流也在所不惜。蚍蜉撼树般的对抗，指向惨烈的结局……

举世闻名的辽沈、淮海、平津三大战役胜利后，西柏坡军民欢庆胜利。三大战役的胜利使蒋家王朝摇摇欲坠，蒋介石（孙飞虎 饰）发表“新年文告”、推出李宗仁（邵宏来 饰）任代总统，导演了一幕假隐退真操纵的丑剧。1949年1月21日，蒋介石由汤恩伯（叶庆林 饰）、蒋经国（陈国典 饰）等陪同，最后一次登上中山陵，之后又在其老家奉化溪口主持了高级军事会议，妄图阻止解放军过长江。3月，中共七届二中全会召开，4月，毛泽东（古月 饰）与朱德（刘怀正 饰）。总司令发出了向全国进军的命令。人民解放军百万雄师强渡长江，攻占总统府，南京胜利解放。5月24日，蒋介石逃往台湾。5月26日，上海解放。随后，全国大部分地区和城市都获得解放。毛泽东先后在中南海会见了国民党起义将领和各界民主人士。开国大典迫在眉睫......

故事发生在抗日战争时期。某市接连发生割喉凶杀案，每次都会留下一张梅花Q的扑克牌,神探孙少武（陈继铭 饰）介入侦破。他发现铁燕子（马捷 饰）和香雪俱乐部老板香雪（石兰 饰）都想获得死者遗失的翡翠，原来翡翠上竟刻有汪日会谈的机密。开古玩店的日特山本（张中熙 饰）支使铁燕子骗孙少武与香雪到郊外，他亲自去警局窃翡翠，不料中计险些丧命。孙少武潜入铁燕子住处，打斗中铁燕子被人割喉谋杀。与此同时，香雪盗窃翡翠未果，悻悻离开警局。最后孙少武知悉，俱乐部的柳小琼（朱娜 饰）正是杀手梅花Q，她的真名叫缨子，是个日本人。她为受汪日密谈受牵连而自杀的父亲报仇，杀死了很多无辜......

取经路上，唐僧（贾永泉 饰）师徒四人遇到豹精（王玉清 饰）到员外家抢亲，经过一番搏杀，寡不敌众的豹精暴毙而亡，员外一家很是高兴。次日，一行四人途经牛魔宫，踫上牛魔王与铁扇公主闹家务，悟空（董志华 饰）出言不逊，得罪了铁扇公主。师徒继续西行，这日，他们来到车池国，如今的车池国被妖孽控制，唐僧率徒在此停留数日，捣毁了妖窟，恢复了昔日宁静的生活。红孩儿（穆立新 饰）接其母铁扇公主信告，得知孙悟空冲撞其母，决心为母报仇。观音菩萨得知唐僧师徒有难，差弟子木吒、金吒与哪吒前往相助，最终收降了红孩儿......　　故事取材于吴承恩名著《西游记》。

南宋末年，赤练仙子李莫愁（孟广美 饰）在江南一带找昔日恋人陆展元（胡东 饰）寻仇。大侠郭靖（王洛勇 饰）与妻子黄蓉（孔琳 饰）在帮忙救助陆展元一家时，发现了乞丐少年杨过（叮当 饰）是其结拜兄弟杨康之子，于是带他回到桃花岛并送到了全真教学艺。成年后的杨过（黄晓明 饰）在全真教中受尽欺辱，幸亏得到了古墓派传人小龙女（刘亦菲 饰）的搭救，从此以后杨过便拜在小龙女门下，并与她开展了一段旷世绝恋。与此同时，郭靖的两个女儿郭芙（陈紫函 饰）与郭襄（杨幂 饰）都阴差阳错的喜欢上了杨过，但却给杨过带来了不同的命运。与此同时蒙古大军对南宋山河虎视眈眈，杨过面对国仇家恨以及儿女情仇，终于从浪荡少年变成了一代神雕大侠，苦等16年后与小龙女也最终修成正果。

大唐天宝年间，长安附近的一个小集镇，名叫鸡鸣镇，乃是进出长安的必经要道。镇上最大的一家酒楼，被人全部包下，原来是范阳节度使安禄山的手下王龙客等人，在这里埋伏。                                                                            　　飞虎山寨主窦令侃和他的义子铁摩勒正好经过，窦令侃本不想多事，但是铁摩勒知道是安禄山手下行事，无法按捺，出手帮助了对方伏击的对象：原来他父母当年皆死于安禄山手下，铁摩勒最大的心愿，就是要为父母报仇，所以和安禄山势不两立。                                                                            　　铁摩勒所救之人，乃是九原太守郭子仪的密使夏凌霜，王龙客等人的目的，是要抢夺她身上郭子仪给李白的密信：密信中，郭子仪要李白告诉玄宗，安禄山要谋反。                                                                            　　夏凌霜谢过铁摩勒，继续赶路，铁摩勒和窦令侃前往鸡鸣镇拜望窦令侃的妹夫段圭璋，没有想到，王龙客等人衔踪而来，暗中抓走了段圭璋的妻子窦线娘。                                                                            　　十八年前，段圭璋被安禄山大军包围，亲生儿子失陷乱军之中，而他的好友铁昆仑战死，史逸如全家也全部下...

红花会总舵主于万亭死后，陈世倌的二儿子陈家洛（黄海冰 饰）接替了舵主的位子。陈家洛有着极为复杂的身世，当今圣上乾隆皇帝（王卫国 饰）甚至有可能就是他的哥哥。在和乾隆进行了一番周旋和交涉之后，乾隆终于同意签署驱清复明的条款，然而，就在这个节骨眼上，和亲王企图勾结后宫谋权篡位，感受到地位受到威胁的乾隆背叛了陈家洛，决定先将尽力放在保住王位上。这让陈家洛和红花会倍感愤怒。　　与此同时，霍青桐（王菁华 饰）和香香公主（杨紫嫣 饰）两位妙龄女子出现在了乾隆和陈家洛的身边，一段复杂的四角恋情就此拉开序幕。在感情、政治和利益面前，陈家洛和乾隆会做出怎样的选择？

慈眉善目的洪飞是“神念功”的老大，他高深莫测、行动诡秘还有特异功能，被信徒们称为圣人。他和手下策划了一场场神功表演，疯狂敛财，谋财害命，甚至还勾结黑社会，绑架了回乡寻亲的姑娘露丝。群众艺术馆的张一民利用各种手段揭穿场场骗局，并偶然搭救了露丝，他因此成为“神功大师”们的眼中钉、肉中刺。　　“神念功”与“太空功”等黑恶势力狼狈为奸，对张一民进行疯狂报复。张一民激烈反击，却厄运连连，不但缠上官司，而且身陷险境。露丝全力帮助，救出张一民，正当他们准备再次为正义而战时，气急败坏、丧心病狂的不法之徒向他们举起了罪恶的枪……此时，一个神秘的“猜谜人”也从山寨来到了南江，一段隐藏了多年的血泪身世故事隐隐浮出水面……　　在亲情和野心面前，人性和兽性将何去何从？在真实和虚幻之间，生存和毁灭将怎样徘徊？罪与罚猛烈碰撞，一场正义与邪恶的生死决斗一触即发……

英俊少年秦歌（陈俊生 饰）深爱着少女鸳鸯（张恒 饰），可惜鸳鸯生于穷苦之家，被买入了酒馆卖艺不卖身，秦歌凑足的银两前去替鸳鸯赎身，哪知道在这个节骨眼上，鸳鸯竟被拜月教主金东方掠走。最终，不堪受辱的鸳鸯选择了自尽，而秦歌身受重伤被张好儿（徐露 饰）救下。　　千金大小姐田思思（季芹 饰）久闻秦歌的大名，发誓非其不嫁，可父亲搭设了比武招亲的擂台，最终获胜的是武功高强的少年杨繁（吴京 饰），相互看不上眼的两人打打闹闹，俨然一对欢喜冤家。金东方和秦歌的父亲因为一场误会而结下了深深的冤仇，如今，金东方要让秦歌体会到她当年的痛苦。错综复杂的关系里，江湖上即将刮起一阵腥风血雨。